Pokémon Shuffle
En este juego tu puedes entrenar y subir de nivel a tus Pokémon por estar usándolos en peleas contra el Pokémon de la fase que te enfrentes.
Cada Pokémon dispone de habilidades especiales que al activarse pueden ser benéficos para limpiar el tablero o para causarle más daño al Pokémon rival. La probabilidad en que estas habilidades se activen varía en las habilidades, pero para la mayoría de éstas, mientras más Pokémon de una misma especie sean alineadas, se torna más probable la activación de la habilidad.
En Pokémon Shuffle se implementa la Mega Evolución como otra forma para ir limpiando el tablero y crear nuevos combos.